آن فقيه بزرگ، صاحب تأليفات فراوان در فقه، حديث، كلام، رجال، تاريخ، شعر و ديگر علوم بود. به قول علامه سيد محسن امين: «او پيشواي رجال و حديث، با تتبعي گسترده، دانستني‌هاي بسيار و حافظه‌اي شگرف بود. هيچ كس از او پرسشي نمي‌كرد، مگر اينكه او را به جاي آن مطلب در كتاب‌ها، با ذكر شماره صفحه حواله مي‌داد».^[1]

مهم‌ترين تأليف وي، كامل كردن عبقات‌الانوار پدرش مير حامد حسين است. مير حامد حسين، خود، مجلدات حديث غدير، حديث منزلت، حديث ولايت، حديث تشبيه و حديث نور را نگاشت، اما عمر پربارش به سر رسيد و كار عبقات به اتمام نرسيد. از اين‌رو، سيد ناصر حسين، به تكميل آن همت گماشت و مجلدات حديث‌الطير، حديث‌الباب، حديث‌الثقلين، حديث‌السفينة و حديث «انا مدينة العلم» را نوشت. اين كتاب‌ها به زبان فارسي بود و در هند به چاپ رسيد. نيز حديث ثقلين، در شش جلد به اهتمام آيت‌الله سيد محمدعلي روضاتي در اصفهان چاپ شد.

همچنين متن همه آنها با تعريب و تلخيص استاد محقق، سيد علي حسيني ميلاني به چاپ رسيد. اين كتاب، همان كتاب نفحات الازهار في خلاصة عبقات الانوار است كه تلخيص، تحقيق و تعريب تمام مجلدات عبقات ـ نوشته ميرحامد حسين، سيد ناصر حسين و سيد محمد سعيد ـ در 20 جلد چاپ شد.

 از ديگر كتاب‌هاي علامه سيد ناصر حسين، مي‌توان به كتاب‌هاي ذيل اشاره كرد:

1. اثبات رد الشمس لأميرالمؤمنين؛^[2]
2. ما ظهر من الفضائل لاميرالمؤمنين يوم خيبر(فارسي)؛^[3]
3. نفحات الازهار في فضائل الائمة الاطهار(16 جلد)؛^[4]
4. مسند فاطمة بنت الحسين(علیه السلام) ؛ ^[5]
5. حاشيه اصول كافي؛^[6]
6. حاشيه كتاب من لا يحضره الفقيه؛^[7]
7. افحام الاعداء والخصوم في نفي تزويج عمر بام كلثوم: اين كتاب، به اهتمام مرحوم حجت‌الاسلام محمدهادي اميني، در تهرانبه چاپ رسيد؛^[8]
8. اسباغ النائل في تحقيق المسائل: مجموعه فتاوا و پاسخ به استفتائات ايشان است كه در نه جلد چاپ شد؛^[9]
9. المفرد في مسئلة وجوب السورة في ‌الركعتين: اين كتاب، نخستين تأليف وي است؛^[10]
10. مفتاح الهداية(اصول دين و فروع دين): سيد شبير حسين هنديآن را به اردو ترجمه كرد و در 1323ق به چاپ رسيد.^[11]
11. الاثمار الشهية في المنشآت العربية؛^[12]
12. انشاء و مكاتيب فارسي؛[13]
13. ديوان اشعار (فارسي، عربي، اردو)؛^[14]
14. كتاب المواعظ(چند جلد)؛
15. سبائك الذهبان في الرجال و الاعيان(48 جزء)؛^[15]
16. خطبه‌هاي جمعه و عيدين: اين كتاب، چاپ شده است؛
17. فهرست انساب سمعاني: علامه شبلي نعمانيدرباره اين كتاب، به او نوشته است:

«خدمتي را كه شما براي اسلام انجام داده‌ايد، آن‌قدر بزرگ است كه به هيچ وجه قابل ارزيابي نيست؛ و براي من، شما واقعاً خضر راه بوديد؛ چون من مدت سه روز بود كه درباره يك موضوع - در انساب سمعاني - سرگردان بودم، ولي شما با يك چشم به هم زدن، مرا به منزل مقصود رسانديد»؛^[16]

18. نفحات الانس؛^[17]
19. النجعة؛^[18]
20. علم الرجال.^[19]

[1]. همان.

[2]. الذريعة، ج 1، ص 95.

[3]. مطلع انوار، ص 671.

[4]. همان.

[5]. همان.

[6]. المسلسلات، ج 2، ص 113.

[7]. همان.

[8]. همان.

[9]. الذريعة، ج 2، ص 3.

[10]. مطلع انوار، ص 671.

[11]. المسلسلات، ج 2، ص 113.

[12]. همان؛ مطلع انوار، ص 671.

[13]. الذريعة، ج 2، ص 395.

[14]. همان، ج 9، ص 1154.

[15]. المسلسلات، ج 2، ص 113؛ مطلع انوار، ص 671.

[16]. مطلع انوار، ص 669.

[17]. المسلسلات، ج 2، ص 113.

[18]. همان.

[19]. مطلع انوار، ص 671.